MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium limicola DSM 245 chromosome

Total Repeats: 7787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010803	AATA	2	8	1	8	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010803	T	6	6	72	77	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010803	TGA	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010803	TTC	2	6	125	130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010803	T	8	8	137	144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010803	GT	3	6	1674	1679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010803	TGA	2	6	1719	1724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010803	AAT	2	6	1729	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010803	GTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010803	CAT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010803	AAC	3	9	1879	1887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010803	AT	3	6	1891	1896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010803	TAA	2	6	1906	1911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010803	A	6	6	4475	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010803	T	7	7	4506	4512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010803	AACA	2	8	5920	5927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010803	AGG	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010803	A	6	6	5996	6001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010803	GAAAA	2	10	8387	8396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010803	A	6	6	8405	8410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010803	TGT	2	6	10323	10328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010803	GTT	2	6	10346	10351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010803	AAAT	2	8	10353	10360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010803	TTA	2	6	10361	10366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010803	CAG	2	6	10512	10517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010803	GTT	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010803	CGG	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010803	A	6	6	10612	10617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010803	TA	3	6	10657	10662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010803	TTG	2	6	10680	10685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010803	GCA	2	6	10715	10720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010803	CA	3	6	10719	10724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010803	T	6	6	10754	10759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010803	AAT	2	6	11648	11653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010803	CAAT	2	8	11677	11684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010803	GTT	2	6	13382	13387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010803	T	10	10	13420	13429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010803	CAGA	2	8	13472	13479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010803	TA	3	6	13501	13506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010803	ATT	2	6	13515	13520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010803	G	6	6	16335	16340	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010803	GTCC	2	8	21022	21029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010803	TTC	2	6	21052	21057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010803	CTC	2	6	21156	21161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010803	AG	4	8	21179	21186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010803	CCG	2	6	23859	23864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010803	AAC	2	6	23917	23922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010803	GTT	2	6	29052	29057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010803	A	6	6	29069	29074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010803	TC	3	6	29742	29747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010803	TAC	2	6	29748	29753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010803	TGC	2	6	30260	30265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010803	CTC	2	6	30291	30296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010803	CAG	2	6	31788	31793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010803	CTG	2	6	31802	31807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010803	T	7	7	31811	31817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010803	TTC	2	6	33613	33618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010803	CTA	2	6	33655	33660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010803	ATTT	2	8	33732	33739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010803	GAA	2	6	33793	33798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010803	AT	3	6	33817	33822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010803	T	9	9	34529	34537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010803	A	7	7	34550	34556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010803	TTC	2	6	36471	36476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010803	T	8	8	36485	36492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010803	T	6	6	36529	36534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010803	T	6	6	36568	36573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010803	TAT	2	6	36581	36586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010803	TAT	2	6	36596	36601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010803	TA	3	6	36614	36619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010803	TA	3	6	36622	36627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010803	ATG	2	6	36681	36686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010803	TGA	2	6	36725	36730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010803	T	6	6	36731	36736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010803	ACC	2	6	36777	36782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010803	AAC	2	6	36783	36788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010803	GAA	2	6	38261	38266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010803	CG	3	6	38553	38558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010803	TG	3	6	38568	38573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010803	CAA	2	6	38584	38589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010803	AGAAA	2	10	38608	38617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010803	AAT	2	6	38618	38623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010803	T	6	6	38638	38643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010803	ATA	2	6	38692	38697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010803	A	7	7	38727	38733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010803	CAG	2	6	38743	38748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010803	ATTT	2	8	38749	38756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010803	TATT	2	8	38772	38779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010803	TA	3	6	38782	38787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010803	TA	3	6	38798	38803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010803	ATA	3	9	38801	38809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010803	AAT	2	6	38821	38826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010803	T	7	7	38868	38874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010803	CAG	2	6	38974	38979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010803	TG	3	6	39028	39033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010803	GAG	2	6	39057	39062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010803	TTTA	2	8	39120	39127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010803	TGTT	2	8	39159	39166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010803	GCA	2	6	43687	43692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010803	CAG	2	6	43694	43699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010803	T	8	8	43706	43713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010803	ACCG	2	8	45108	45115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010803	A	6	6	45127	45132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010803	TTTC	2	8	45149	45156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010803	TTA	3	9	45162	45170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010803	TA	3	6	45175	45180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010803	TA	3	6	45191	45196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010803	A	7	7	45245	45251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010803	GAG	2	6	45252	45257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010803	TCA	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010803	T	8	8	46165	46172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010803	CTCTG	2	10	46230	46239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010803	CT	3	6	46258	46263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010803	A	6	6	46320	46325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010803	CAT	2	6	46333	46338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010803	AGGA	2	8	46379	46386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010803	GTT	2	6	46388	46393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010803	TTCG	2	8	48616	48623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010803	CAA	2	6	48654	48659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010803	A	6	6	48658	48663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010803	GCC	2	6	48697	48702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010803	AG	3	6	48765	48770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010803	CGG	2	6	48795	48800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010803	T	7	7	48846	48852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010803	A	6	6	49400	49405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010803	CA	3	6	49416	49421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010803	T	6	6	49460	49465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010803	TAAATT	2	12	49505	49516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010803	TA	3	6	52069	52074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010803	A	7	7	52184	52190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010803	TGA	2	6	52748	52753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010803	CTC	2	6	52796	52801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010803	GCG	2	6	54263	54268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010803	T	6	6	54275	54280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010803	CTT	2	6	54286	54291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010803	GAGC	2	8	54299	54306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010803	A	6	6	54430	54435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010803	CCG	2	6	54581	54586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010803	CT	3	6	54634	54639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010803	GAC	2	6	54694	54699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010803	ACA	2	6	54712	54717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010803	AGG	2	6	54728	54733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010803	ATC	2	6	55067	55072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010803	TTG	2	6	56612	56617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010803	GGA	2	6	56627	56632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010803	T	7	7	56686	56692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010803	ATT	2	6	56718	56723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010803	GGAT	2	8	56829	56836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010803	TTC	2	6	56843	56848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010803	ATT	2	6	56868	56873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_010803	GC	3	6	56913	56918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010803	TCT	2	6	56926	56931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_010803	TCT	2	6	59884	59889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_010803	TCA	2	6	59914	59919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_010803	CATT	2	8	103465	103472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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283	NC_010803	GGT	2	6	107970	107975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_010803	A	6	6	108041	108046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_010803	CGG	2	6	110852	110857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_010803	T	7	7	110859	110865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010803	AAC	2	6	110871	110876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_010803	AGA	2	6	112623	112628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010803	TGA	2	6	112652	112657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_010803	GTT	2	6	112787	112792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_010803	A	6	6	112823	112828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_010803	G	6	6	125888	125893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
422	NC_010803	TCAGC	2	10	125936	125945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
423	NC_010803	GCT	2	6	125996	126001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_010803	CTG	2	6	126882	126887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_010803	ACGA	2	8	126894	126901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
427	NC_010803	TTC	2	6	126974	126979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_010803	GAT	3	9	127030	127038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_010803	ACC	2	6	127254	127259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_010803	TGT	2	6	127421	127426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_010803	CGTT	2	8	127567	127574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
433	NC_010803	GT	3	6	127815	127820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_010803	GCTG	2	8	127890	127897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
436	NC_010803	AGC	2	6	127928	127933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_010803	T	6	6	128472	128477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_010803	GGC	2	6	128820	128825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_010803	T	7	7	129117	129123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_010803	TAT	2	6	144053	144058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010803	TGG	2	6	144067	144072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_010803	TAAA	2	8	144083	144090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_010803	TCT	2	6	144158	144163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_010803	CCG	2	6	144210	144215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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458	NC_010803	GAG	2	6	144278	144283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_010803	AGG	2	6	144802	144807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_010803	GGAAT	2	10	144845	144854	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_010803	ATA	2	6	145548	145553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_010803	TCC	2	6	149761	149766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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480	NC_010803	ATT	2	6	149885	149890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_010803	A	8	8	149902	149909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_010803	TGT	2	6	150357	150362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_010803	TCA	2	6	150522	150527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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